La investigadora Ikerbasque Ainara Castellanos, investigadora Ikerbasque en la UPV/EHU, ha liderado un estudio que ha sido publicado en la prestigiosa revista Scientific Reports en el que se describe un nuevo enfoque RT-QPCR para la cuantificación relativa del resíduo específico de la metilación m6A del ARN de genes inmunológicos.
La N6-metiladenosina (m6A) es la modificación de ARN más frecuente y abundante. Estudios recientes han demostrado su importancia en la regulación de varios procesos biológicos, incluyendo la respuesta inmune, y se han desarrollado diferentes enfoques para mapear y cuantificar las marcas m6A. Sin embargo, la detección específica de m6A es técnicamente difícil, y los protocolos existentes son largos y tediosos, pues a menudo implican la secuenciación más avanzada.
En este trabajo liderado por Ainara se describe un enfoque simple basado en RT-QPCR para la cuantificación relativa de las regiones m6A candidatas que aprovechan la capacidad disminuida de la enzima BstI para retrotranscribir residuos de m6A. Usando esta técnica, han podido confirmar la metilación m6A recientemente descrita en la 3'UTR de las transcripciones de los genes inmunológicos SOCS1 y SOCS3. Además, utilizando el método aquí presentado, también han observado alteraciones en los niveles relativos de m6A en genes SOCS de pacientes con enfermedad celíaca y en Células β pancreáticas expuestas a estímulos inflamatorios.
Para más información, se puede acceder a la publicación: https://rdcu.be/bqC8Q
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